Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rabgef1Q9JM13 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rabgef1Q9JM13 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rabgef1Q9JM13 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rabgef1Q9JM13 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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