Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx5Q9JL61 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx5Q9JL61 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx5Q9JL61 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx5Q9JL61 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx5Q9JL61 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx5Q9JL61 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
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