Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr10Q9JL21 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr10Q9JL21 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr10Q9JL21 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccr10Q9JL21 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr10Q9JL21 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms