Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cngb3Q9JJZ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cngb3Q9JJZ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cngb3Q9JJZ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cngb3Q9JJZ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cngb3Q9JJZ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cngb3Q9JJZ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cngb3Q9JJZ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cngb3Q9JJZ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cngb3Q9JJZ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cngb3Q9JJZ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cngb3Q9JJZ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cngb3Q9JJZ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cngb3Q9JJZ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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