Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bco1Q9JJS6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bco1Q9JJS6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bco1Q9JJS6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bco1Q9JJS6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bco1Q9JJS6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bco1Q9JJS6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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