Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc12a4Q9JIS8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc12a4Q9JIS8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc12a4Q9JIS8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc12a4Q9JIS8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms