Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MkksQ9JI70 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MkksQ9JI70 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MkksQ9JI70 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MkksQ9JI70 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MkksQ9JI70 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MkksQ9JI70 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MkksQ9JI70 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MkksQ9JI70 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MkksQ9JI70 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MkksQ9JI70 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MkksQ9JI70 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MkksQ9JI70 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MkksQ9JI70 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MkksQ9JI70 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MkksQ9JI70 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MkksQ9JI70 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MkksQ9JI70 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 389 ms