Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tssc4Q9JHE7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tssc4Q9JHE7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tssc4Q9JHE7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tssc4Q9JHE7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms