Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc28a3Q9ERH8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc28a3Q9ERH8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc28a3Q9ERH8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms