Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SgshQ9EQ08 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SgshQ9EQ08 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SgshQ9EQ08 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SgshQ9EQ08 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SgshQ9EQ08 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SgshQ9EQ08 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms