Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sil1Q9EPK6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Sil1Q9EPK6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sil1Q9EPK6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sil1Q9EPK6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sil1Q9EPK6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sil1Q9EPK6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sil1Q9EPK6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sil1Q9EPK6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sil1Q9EPK6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sil1Q9EPK6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sil1Q9EPK6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sil1Q9EPK6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sil1Q9EPK6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sil1Q9EPK6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sil1Q9EPK6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sil1Q9EPK6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sil1Q9EPK6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sil1Q9EPK6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms