Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc38a3Q9DCP2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc38a3Q9DCP2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc38a3Q9DCP2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc38a3Q9DCP2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc38a3Q9DCP2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms