Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Eif3fQ9DCH4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3fQ9DCH4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3fQ9DCH4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3fQ9DCH4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms