Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SelenooQ9DBC0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SelenooQ9DBC0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SelenooQ9DBC0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SelenooQ9DBC0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SelenooQ9DBC0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SelenooQ9DBC0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SelenooQ9DBC0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SelenooQ9DBC0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SelenooQ9DBC0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SelenooQ9DBC0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SelenooQ9DBC0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SelenooQ9DBC0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SelenooQ9DBC0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SelenooQ9DBC0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SelenooQ9DBC0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms