Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sgf29Q9DA08 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sgf29Q9DA08 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgf29Q9DA08 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sgf29Q9DA08 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgf29Q9DA08 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms