Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Subh2bvQ9D9Z7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Subh2bvQ9D9Z7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Subh2bvQ9D9Z7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms