Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D7E4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D7E4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D7E4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D7E4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D7E4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D7E4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D7E4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D7E4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D7E4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D7E4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D7E4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D7E4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9D7E4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms