Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Pfn4Q9D6I3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pfn4Q9D6I3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pfn4Q9D6I3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pfn4Q9D6I3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfn4Q9D6I3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms