Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt34Q9D646 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt34Q9D646 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt34Q9D646 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt34Q9D646 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt34Q9D646 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt34Q9D646 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt34Q9D646 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt34Q9D646 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt34Q9D646 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt34Q9D646 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt34Q9D646 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt34Q9D646 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt34Q9D646 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt34Q9D646 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.2 ms