Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc2hc1bQ9D534 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zc2hc1bQ9D534 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zc2hc1bQ9D534 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zc2hc1bQ9D534 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms