Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3404Q9D506 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3404Q9D506 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3404Q9D506 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm3404Q9D506 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3404Q9D506 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3404Q9D506 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3404Q9D506 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms