Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc105Q9D4K7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc105Q9D4K7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc105Q9D4K7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc105Q9D4K7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc105Q9D4K7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc105Q9D4K7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc105Q9D4K7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc105Q9D4K7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc105Q9D4K7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc105Q9D4K7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc105Q9D4K7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc105Q9D4K7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc105Q9D4K7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc105Q9D4K7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms