Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fsip1Q9D3V5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fsip1Q9D3V5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fsip1Q9D3V5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fsip1Q9D3V5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fsip1Q9D3V5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fsip1Q9D3V5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fsip1Q9D3V5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fsip1Q9D3V5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fsip1Q9D3V5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fsip1Q9D3V5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fsip1Q9D3V5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Fsip1Q9D3V5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fsip1Q9D3V5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fsip1Q9D3V5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fsip1Q9D3V5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fsip1Q9D3V5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fsip1Q9D3V5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fsip1Q9D3V5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fsip1Q9D3V5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Fsip1Q9D3V5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Fsip1Q9D3V5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fsip1Q9D3V5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fsip1Q9D3V5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fsip1Q9D3V5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fsip1Q9D3V5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fsip1Q9D3V5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fsip1Q9D3V5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fsip1Q9D3V5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms