Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vsig1Q9D2J4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vsig1Q9D2J4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vsig1Q9D2J4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vsig1Q9D2J4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vsig1Q9D2J4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vsig1Q9D2J4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vsig1Q9D2J4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms