Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mrpl28Q9D1B9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl28Q9D1B9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl28Q9D1B9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl28Q9D1B9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms