Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Q7

Mrpl45, 39S ribosomal protein L45, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl45Q9D0Q7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl45Q9D0Q7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl45Q9D0Q7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl45Q9D0Q7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl45Q9D0Q7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl45Q9D0Q7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mrpl45Q9D0Q7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl45Q9D0Q7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl45Q9D0Q7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mrpl45Q9D0Q7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl45Q9D0Q7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl45Q9D0Q7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl45Q9D0Q7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl45Q9D0Q7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl45Q9D0Q7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl45Q9D0Q7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl45Q9D0Q7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms