Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR8

Tsfm, Elongation factor Ts, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsfmQ9CZR8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TsfmQ9CZR8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TsfmQ9CZR8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TsfmQ9CZR8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TsfmQ9CZR8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TsfmQ9CZR8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms