Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gins3Q9CY94 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gins3Q9CY94 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gins3Q9CY94 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms