Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXX9

Cuedc2, CUE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cuedc2Q9CXX9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cuedc2Q9CXX9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cuedc2Q9CXX9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cuedc2Q9CXX9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cuedc2Q9CXX9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cuedc2Q9CXX9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cuedc2Q9CXX9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cuedc2Q9CXX9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cuedc2Q9CXX9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cuedc2Q9CXX9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cuedc2Q9CXX9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cuedc2Q9CXX9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cuedc2Q9CXX9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cuedc2Q9CXX9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cuedc2Q9CXX9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cuedc2Q9CXX9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms