Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud1Q9CUB6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otud1Q9CUB6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Otud1Q9CUB6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otud1Q9CUB6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms