Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd1bQ9CSU0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rprd1bQ9CSU0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rprd1bQ9CSU0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rprd1bQ9CSU0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms