Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cox16Q9CR63 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cox16Q9CR63 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cox16Q9CR63 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cox16Q9CR63 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cox16Q9CR63 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cox16Q9CR63 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms