Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Higd2aQ9CQJ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Higd2aQ9CQJ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Higd2aQ9CQJ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Higd2aQ9CQJ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms