Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ergic3Q9CQE7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ergic3Q9CQE7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ergic3Q9CQE7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ergic3Q9CQE7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms