Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp6v0e1Q9CQD8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp6v0e1Q9CQD8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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