Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp1b2Q9CQD4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp1b2Q9CQD4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chmp1b2Q9CQD4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp1b2Q9CQD4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp1b2Q9CQD4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms