Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700029P11RikQ9CQ68 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
1700029P11RikQ9CQ68 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
1700029P11RikQ9CQ68 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms