Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ska1Q9CPV1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ska1Q9CPV1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ska1Q9CPV1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ska1Q9CPV1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ska1Q9CPV1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ska1Q9CPV1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ska1Q9CPV1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms