Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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