Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Rrbp1Q99PL5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Rrbp1Q99PL5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rrbp1Q99PL5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rrbp1Q99PL5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rrbp1Q99PL5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rrbp1Q99PL5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rrbp1Q99PL5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rrbp1Q99PL5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rrbp1Q99PL5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rrbp1Q99PL5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Rrbp1Q99PL5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rrbp1Q99PL5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Rrbp1Q99PL5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rrbp1Q99PL5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rrbp1Q99PL5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rrbp1Q99PL5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rrbp1Q99PL5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rrbp1Q99PL5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rrbp1Q99PL5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rrbp1Q99PL5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rrbp1Q99PL5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rrbp1Q99PL5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rrbp1Q99PL5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rrbp1Q99PL5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rrbp1Q99PL5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rrbp1Q99PL5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rrbp1Q99PL5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rrbp1Q99PL5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rrbp1Q99PL5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rrbp1Q99PL5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rrbp1Q99PL5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rrbp1Q99PL5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rrbp1Q99PL5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rrbp1Q99PL5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rrbp1Q99PL5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rrbp1Q99PL5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rrbp1Q99PL5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rrbp1Q99PL5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rrbp1Q99PL5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rrbp1Q99PL5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rrbp1Q99PL5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Rrbp1Q99PL5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rrbp1Q99PL5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rrbp1Q99PL5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Rrbp1Q99PL5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rrbp1Q99PL5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rrbp1Q99PL5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Rrbp1Q99PL5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rrbp1Q99PL5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rrbp1Q99PL5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rrbp1Q99PL5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Rrbp1Q99PL5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rrbp1Q99PL5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Rrbp1Q99PL5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rrbp1Q99PL5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rrbp1Q99PL5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Rrbp1Q99PL5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms