Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930550L24RikQ99PA7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930550L24RikQ99PA7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930550L24RikQ99PA7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930550L24RikQ99PA7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930550L24RikQ99PA7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms