Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RetnQ99P87 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RetnQ99P87 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RetnQ99P87 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RetnQ99P87 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms