Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf2ird2Q99NI3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf2ird2Q99NI3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gtf2ird2Q99NI3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms