Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rnf17Q99MV7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rnf17Q99MV7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rnf17Q99MV7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rnf17Q99MV7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rnf17Q99MV7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rnf17Q99MV7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rnf17Q99MV7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rnf17Q99MV7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rnf17Q99MV7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rnf17Q99MV7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rnf17Q99MV7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rnf17Q99MV7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rnf17Q99MV7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rnf17Q99MV7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rnf17Q99MV7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Rnf17Q99MV7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rnf17Q99MV7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rnf17Q99MV7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Rnf17Q99MV7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Rnf17Q99MV7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rnf17Q99MV7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rnf17Q99MV7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Rnf17Q99MV7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rnf17Q99MV7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rnf17Q99MV7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rnf17Q99MV7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rnf17Q99MV7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rnf17Q99MV7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rnf17Q99MV7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rnf17Q99MV7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rnf17Q99MV7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rnf17Q99MV7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rnf17Q99MV7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rnf17Q99MV7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Rnf17Q99MV7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rnf17Q99MV7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Rnf17Q99MV7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rnf17Q99MV7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rnf17Q99MV7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rnf17Q99MV7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rnf17Q99MV7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Rnf17Q99MV7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rnf17Q99MV7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rnf17Q99MV7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms