Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TriobpQ99KW3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TriobpQ99KW3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TriobpQ99KW3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TriobpQ99KW3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TriobpQ99KW3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TriobpQ99KW3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms