Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ufsp2Q99K23 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ufsp2Q99K23 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ufsp2Q99K23 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ufsp2Q99K23 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ufsp2Q99K23 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms