Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EpcamQ99JW5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EpcamQ99JW5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EpcamQ99JW5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EpcamQ99JW5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EpcamQ99JW5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EpcamQ99JW5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EpcamQ99JW5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EpcamQ99JW5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EpcamQ99JW5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms