Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krcc1Q99JT5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krcc1Q99JT5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krcc1Q99JT5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krcc1Q99JT5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms