Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ophn1Q99J31 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ophn1Q99J31 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ophn1Q99J31 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ophn1Q99J31 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ophn1Q99J31 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ophn1Q99J31 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms