Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mthfd1Q922D8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mthfd1Q922D8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mthfd1Q922D8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mthfd1Q922D8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mthfd1Q922D8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mthfd1Q922D8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mthfd1Q922D8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mthfd1Q922D8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mthfd1Q922D8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mthfd1Q922D8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mthfd1Q922D8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mthfd1Q922D8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mthfd1Q922D8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms